JPlag compara los programas intentando cubrir uno de los programas con secuencias (preferiblemente grandes) del otro programa. La cobertura de un programa se define como la proporción del código de fuente frente al tamaño total del código de fuente.
La semejanza media se define como la media de la cobertura de
ambos programas.
Esta es la semejanza por defecto que funciona en la mayoría de los casos: Las
coincidencias con una alta semajanza media indica que esos programas funcionan
de una forma muy similar.
La semejanza máxima se define como la mayor de ambas coberturas del programa.
Este ranking es especialmente útil en programas que son muy diferentes en tamaño. Esto
se puede manifestar cuando se introducen grandes porciones de código dentro de uno de ellos
para que no se distinga respecto al programa plagiado.